《石头记》第一作者是石涛，贾雨村是兴隆街的大爷，第一隐写是其一世祖、朱元璋的大哥朱兴隆。“西方灵河岸上”其中隐写了漓江之畔的桂林与湘江之畔的全州，这两条江都发源于灵渠。其父桂林靖江王朱亨嘉于贾母的第二个生日这天（顺治二年八月初三）在桂林以“洪武”为年号称帝，是庚辰本中的“林代玉”，朱元璋的璋就是玉。第二十七回“至次日，乃是四月二十六日”隐写了南明灭亡，也暗藏了石涛的父亲朱亨嘉在顺治三年四月二十六日被隆武帝缢杀，也是“玉带林中挂”的结局。“遮天大王”其一隐喻就是取代洪武的朱亨嘉。朱亨嘉僭号篡位，被隆武帝麾下攻破王城活捉。这天，三岁的石涛在内官“襁褓”之中躲在“雪洞（薛宝钗住处）”中，然后逃到全州湘山寺出家。
石涛自称苦瓜和尚，苦瓜即癞瓜，所以，林黛玉三岁遇癞头和尚。“吾道清湘岂是男”，“潇湘妃子”也是石涛身世的隐写。“出腋知君岁在壬”，石涛生于壬午除夕。
另一个作者是大明宁王之后八大山人，宁国府之一隐写就是八大山人家。八大山人自称弋阳王孙，书中的弋阳腔是其身世写照。“无材可去补苍天”出自八大山人《题自画石》：“有志归完璞，无材去补天”。
书中的顽石蠢物首先隐写大明，其次就是作者自喻。顽即愚顽，就是蠢物，“仙缘——《邯郸梦》中伏甄宝玉”，借用的是八大山人家世交汤显祖的剧作，戏中的卢生是蠢物，蠢物即驴，八大山人自称“没毛驴，初生兔。”
石涛的二世祖朱文正小名驴儿，朱元璋骂他是“驴马之人”。
八大山人辈分高年龄大，书中“命芹溪”之类的脂批，符合八大山人与石涛的关系。
书中还有非常多的石涛与八大山人家史与身世自述，在此就不多罗列了。