潇湘妃子隐写了作者石涛的身世与南明灭亡。朱元璋大哥名叫朱兴隆，贾雨村是兴隆街的大爷，第一隐喻就是石涛的一世祖。
石涛是桂林靖江王朱亨嘉之子，顺治二年八月初三（贾母第二个生日），朱亨嘉改桂林为西京，以“洪武”为年号称帝，这是“林代玉”其中之一隐喻。朱元璋的璋就是玉，白玉祭祀瑞器，白玉有朱乃是赤瑕。
朱亨嘉“遮天”称帝，被隆武帝部下攻破靖江王城活捉。当天，王府内官以襁褓（背小孩的背带）背着三岁的石涛躲进王府雪洞（薛宝钗住处）中隐藏，然后逃到全州湘山寺出家。桂林漓江、全州湘江都发源于灵渠，都在“西方灵河岸上”。石涛后来自称苦瓜和尚，苦瓜即癞瓜，所以，林黛玉三岁遇癞头和尚。
石涛在《庚辰除夜》诗中说：“吾道清湘岂是男”，不是男就是女。全州本属潇湘，石涛因而以“潇湘妃子”把自己的身世写进了《石头记》。
朱由榔在书中以尤二姐隐喻，尤二姐身上有槟榔，就是由榔。朱由榔出自衡州桂王家，衡州也有湘江流经，还是“西方灵河岸上” 。大明朱氏来自牵牛织女分野之临淮（凤阳），四大名著以牛、女、纺、织、经、巧、乞巧等等隐喻。“潇湘妃子”最终的隐喻是南明永历帝。
“玉带林中挂”既隐写了朱由检自缢，也隐写了朱由榔被吴三桂以弓弦缢杀。二帝都是木字辈，双木为“林”。石涛的父亲朱亨嘉被隆武帝缢杀，堂叔、最后一个靖江王朱亨歅被孔有德缢杀，还是“玉带林中挂”。
孔有德隐藏在“这年十一月三十日冬至”之中。这个冬至节指的是崇祯四年，这一年，孔有德发动了吴桥兵变。