荆汉运河面临的挑战可不少。从工程技术层面看，要穿越复杂的地质区域，像江汉平原部分地段土质松软，在挖掘和建设时，得保证运河堤岸稳固，防止坍塌，这对施工技术要求极高，成本也会增加。
生态保护也是一大难题。运河建设可能会破坏沿线的湿地、河流生态系统，影响众多野生动植物的栖息地。比如一些珍稀鸟类可能会失去觅食和栖息场所。
还有就是协调问题。荆汉运河涉及多个地区和部门，在规划、建设和管理过程中，各方利益诉求不同，要统一意见、协同推进，难度可不小。