不过，近年来也有观察指出，国民党的两岸路线有向民进党靠拢的趋势，导致外界产生“一丘之貉”的印象。

具体区别主要体现在以下几个方面：

· 两岸关系（最根本区别）：国民党承认两岸同属一个国家、反对“台独”，认为应在“宪政架构”下与大陆交流、追求和平；民进党则将“建立主权独立自主的台湾共和国”写入黨綱，坚持“台独”立场。
· 政治风格：国民党相对“小心谨慎”，被形容为“笨”、“烂”、“软弱”；民进党则“胆大妄为”、手段灵活，被形容为“坏”、“凶狠”、“狡猾”，甚至敢公然否定“宪法”。
· 历史渊源与认同：国民党源自大陆，与中国历史渊源深厚；民进党则出自台湾本土，强调“本土化”，并长期将国民党塑造为“外来政权”。

近年来国民党的两岸论述模糊化。有评论认为，若国民党为选举而向民进党靠拢，甚至附和其说法，便是与民进党“一丘之貉”，可能将台湾“逼入绝境”。

总的来看，两党在核心政治目标（统独议题） 上存在本质区别，但近年的政治操作手法确有趋同迹象，这是“一丘之貉”说法的由来。