抗日战争期间，吴芝圃在豫苏皖地区领导敌后游击战争，他虽然担任了豫苏皖取党委书记，但却坚决不搞特殊，与同志们同甘共苦，没有任何的特殊照顾和补贴。

由于驻地在永南涡北地区，当地的麦子产量很低，杂粮多，秋季以高梁为主，其次红薯也是主食，大约三分之二的时间吃不上麦面。最困难时只能吃高梁面惯。

当时称之为“三红一白”，即红高梁馍(窝窝头）、红薯汤、辣椒面与喝白开水，作为领导的吴芝圃始终和下面的同志吃一样的东西。有人想要申请领取麦子，吴芝圃始终不同意这些申请。

在生活上，吴芝圃住的房子是普通的茅草屋，穿的军衣、军鞋、军袜也和普通士兵一样。平时出行虽配了匹马，但只有在出远门时吴芝圃才会骑马。即便有时候骑马，为了表现出尊重群主，走到村外才骑上马，没进村就会提前下马。

对于干部的个人享乐，吴芝圃也进行过猛烈批判，称一些干部是把人民用血汗生产出来的公粮看做黄土，而个人生活惟恐不舒适，招待客人惟恐不阔绰，所谓“取之尽铢，用之如泥沙”的剥削阶级的思想意识的发展，更是已成了“司空见惯”的现象。