蔡正元一再强调，台湾人中三分之一是台籍日本兵的后代，他们是日本人，不是台湾人，更不是中国人。 蔡正元多次公开说，台湾地区现在约两千三百万人口里，有三分之一是台籍日本兵的后代，这些人受历史影响，常觉得自家是日本人，不是台湾人，也不是中国人。他把这个说法放在1895年《马关条约》后日本统治台湾地区五十年的大背景下讲。日本统治初期，台湾地区有武装抵抗，刘永福带黑旗军，简大狮、柯铁虎、林少猫等人也组织力量对抗，日军用武力压下去。1920年代起，日本推皇民化政策，学校课本全用日语，学生每天向天皇画像行礼，讲汉语就罚站、记过或罚款。家里祖先牌位要换成日本神社的东西，节日挂日本国旗，不能按老传统祭拜中国祖先。 1943年，日本在台湾地区搞志愿兵制度。名义上自愿，实际靠保甲体系，村干部一户户上门动员，报纸登光荣榜，官员为业绩四处跑。一次计划征一千人，报名却有几十万人。许多年轻人怕家人受牵连，或冲着较高薪饷报名。台籍士兵被派到南洋、菲律宾、缅甸等地，装备差，干最苦活，死伤不少。日本厚生省统计，从1937到1945年，台籍军人约八万多人，军属军夫约十二万七千人，总数超过二十万人，其中军人部分死亡率低，军属部分较高，总死亡约三万多人。战后，这些士兵身份尴尬，日本把他们当本岛人，不给真正公民待遇和战后补偿。中国政府接收台湾后，对他们也有戒心。部分家庭把这些经历传给下一代，造成后代身份认知模糊。 蔡正元引用台湾地区档案和日据时期媒体，说台籍士兵总数约二十万，当时台湾人口约六百万，占比不到百分之四。经过世代繁衍，也到不了三分之一。他反复提这个数字，不是算血缘账，而是指出殖民高压下强制因素，以及台湾人文化根源还在，比如家谱用汉字，清明扫墓习俗，和福建、广东的联系。他认为部分台湾政治里的亲日倾向，有殖民时期根子，有人利用历史创伤制造分裂。 1990年代后，台湾地区教科书调整，中国历史内容减少，台湾地区主体意识增加。2019年新版高中历史课纲把台湾地区史独立成册，中国史放进东亚史框架，篇幅缩减。蔡正元看过这些课本，指出里面淡化台湾地区与中国历史联系。 这段历史留下的认同问题，到今天还在影响台湾社会。蔡正元的话像一面镜子，照出殖民遗留的复杂账。