稀土精炼过程会产生不少废料。废渣是常见的一种，比如在提取稀土元素时，矿石中的脉石矿物等杂质会形成废渣。像包头稀土矿在冶炼过程中，就会产生大量含有硅、钙等成分的废渣。废水也是重要的废料，精炼过程中使用的各种化学药剂和水混合后排出，里面含有重金属离子、酸碱物质等。例如一些稀土分离厂的废水中，可能含有钍等放射性元素。废气同样不可忽视，在高温焙烧等环节会产生含氟、硫等污染物的废气，对大气环境有一定影响。这些废料处理不好，会对环境造成很大压力。